Luego de un año de haber dejado el cargo como secretario de Seguridad y de haberse iniciado una investigación desde la Contraloría por la contratación de su compadre Mario Alberto Martínez Razo como director general 2 sin contar con el perfil, habilidad profesional, capacidad y experiencia, los Tribunales de Justicia Administrativa determinaron solo amonestar a Luis Enrique Ramírez Saldaña por esta falta.
En 2019 la Contraloría inició un procedimiento de responsabilidad administrativa a Luis Enrique Ramírez Saldaña por revisar y autorizar el formato de resumen de resultados de selección para que se le diera seguimiento a la contratación de Mario Alberto Martínez Razo como director administrativo de la secretaría, con lo que infringió el artículo 49 fracción I de la Ley de Responsabilidades Administrativas de los Servidores Públicos del estado de Guanajuato y sus Municipios.
Por tal motivo, el 17 de enero de 2020 se llevó a cabo la audiencia inicial y el 16 de marzo del mismo año se declaró cerrada la instrucción y se citó a las partes a escuchar la resolución.
No obstante, con motivo de la pandemia y la contingencia sanitaria se detuvieron todas las actividades, de tal forma que fue apenas el pasado 29 de junio de 2020 que se dio a conocer la resolución de dicha investigación, la cual no fue impugnada por el exsecretario de Seguridad, Luis Enrique Ramírez Saldaña, ya que por la falta cometida al autorizar la contratación de su compadre solo fue amonestado, considerada una sanción leve que queda como un antecedente disciplinario.
Desde hace algunos meses, incluso antes de que concluyera su prestación de protección personal con escoltas por un año, por voluntad propia el exsecretario devolvió a la Secretaría de Seguridad los tres elementos que permanecían con él como escoltas desde que dejó el puesto, así como los vehículos que les fueron asignados para ese acompañamiento, de tal forma que ya no goza de ninguna prerrogativa.